蝴蝶蘭抗病原菌性狀之分子標誌

以全基因體關聯分析建立蝴蝶蘭抗病原菌性狀之分子標誌

資料說明:

raw data 為 paired-end 150 bp 全基因組解序之序列
vcf data為不同個體進行SNP calling 之後的位置與數據

資料使用方法:

raw data: 須經過Reference alignment 等過程才能知道片段之位置，亦或者進行de novo assembly 為新的全基因組
vcf data：在個體中找到存在有位點差異之位置，若將所有個體的vcf整合分析後，可找出族群中的SNP

Data and Resources

N0049.R1.fastq.gz
解壓縮後為N0049 r1的原始資料
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N0049.R2.fastq.gz
解壓縮後為N0049 r2的原始資料
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N0049.sorted.Marked_duplicate.bam.vcf.zipZIP
解壓縮後為 N0049 序列的結果檔，vcf 為明文編碼
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N0183.R1.fastq.gz
N0183 的基因序列原始檔
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N0183.R2.fastq.gz
N0183 r2的原始壓縮檔
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N0183.sorted.Marked_duplicate.bam.vcf.zipZIP
解壓縮後為 N0183 序列的結果檔，vcf 為明文編碼
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Additional Info

Field	Value
Last Updated	August 24, 2021, 11:25 (CST)
Created	August 11, 2021, 08:10 (CST)
detail	http://orchidbase.itps.ncku.edu.tw/EST/download.aspx
維護窗口	http://orchidbase.itps.ncku.edu.tw/EST/Contacts.aspx

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